Музей учрежден 21 июля 1992 года и сегодня является научно-исследовательским, образовательным и культурно-досуговым центром города. Фонды музея насчитывают свыше 30 тысяч единиц хранения, которые представлены рядом уникальных коллекций. Среди них палеонтологическая и минералогическая коллекции, коллекция живописи, графики и декоративно-прикладного искусства. Центральными экспонатами являются: диорама природы Курского края и диорама Михайловского железорудного карьера. Предпосылкой формирования палеонтологической и минералогической коллекций в музее явилось то обстоятельство, что на территории Железногорского района находится крупнейшее месторождение железной руды Курской магнитной аномалии - Михайловское месторождение.
